Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM)

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  1. Deep learning for tissue microarray image-based outcome prediction in patients with colorectal cancer

    Bychkov, D., Turkki, R., Haglund, C., Linder, N. & Lundin, J. 2016 p. 979115 6 p.

    Publication: Conference contributionA4 Article in conference publication (refereed)

  2. Longitudinal Heritability of Childhood Aggression

    Porsch, R. M., Middeldorp, C. M., Cherny, S. S., Krapohl, E., van Beijsterveldt, C. E. M., Loukola, A., Korhonen, T., Pulkkinen, L., Corley, R., Rhee, S., Kaprio, J., Rose, R. R., Hewitt, J. K., Sham, P., Plomin, R., Boomsma, D. I. & Bartels, M. Jul 2016 In : American journal of medical genetics. Part B, Neuropsychiatric genetics. 171, 5, p. 697-707 11 p.

    Publication: Contribution to journalA1 Refereed journal article

  3. The genetic architecture of type 2 diabetes

    Fuchsberger, C., Flannick, J., Teslovich, T. M., Mahajan, A., Agarwala, V., Gaulton, K. J., Ma, C., Fontanillas, P., Moutsianas, L., McCarthy, D. J., Rivas, M. A., Perry, J. R. B., Sim, X., Blackwell, T. W., Robertson, N. R., Rayner, N. W., Cingolani, P., Locke, A. E., Tajes, J. F., Highland, H. M., Dupuis, J., Chines, P. S., Lindgren, C. M., Hartl, C., Jackson, A. U., Chen, H., Huyghe, J. R., van de Bunt, M., Pearson, R. D., Kumar, A., Mueller-Nurasyid, M., Grarup, N., Stringham, H. M., Gamazon, E. R., Lee, J., Chen, Y., Scott, R. A., Below, J. E., Chen, P., Huang, J., Go, M. J., Stitzel, M. L., Pasko, D., Parker, S. C. J., Varga, T. V., Green, T., Beer, N. L., Day-Williams, A. G., Ferreira, T., Fingerlin, T., Horikoshi, M., Hu, C., Huh, I., Ikram, M. K., Kim, B-J., Kim, Y., Kim, Y. J., Kwon, M-S., Lee, J., Lee, S., Lin, K-H., Maxwell, T. J., Nagai, Y., Wang, X., Welch, R. P., Yoon, J., Zhang, W., Barzilai, N., Voight, B. F., Han, B-G., Jenkinson, C. P., Kuulasmaa, T., Kuusisto, J., Manning, A., Ng, M. C. Y., Palmer, N. D., Balkau, B., Stancakova, A., Abboud, H. E., Boeing, H., Giedraitis, V., Prabhakaran, D., Gottesman, O., Scott, J., Carey, J., Kwan, P., Grant, G., Smith, J. D., Neale, B. M., Purcell, S., Butterworth, A. S., Howson, J. M. M., Lee, H. M., Lu, Y., Kwak, S-H., Zhao, W., Danesh, J., Lam, V. K. L., Park, K. S., Saleheen, D., So, W. Y., Tam, C. H. T., Afzal, U., Aguilar, D., Arya, R., Aung, T., Chan, E., Navarro, C., Cheng, C-Y., Palli, D., Correa, A., Curran, J. E., Rybin, D., Farook, V. S., Fowler, S. P., Freedman, B. I., Griswold, M., Hale, D. E., Hicks, P. J., Khor, C-C., Kumar, S., Lehne, B., Thuillier, D., Lim, W. Y., Liu, J., van der Schouw, Y. T., Loh, M., Musani, S. K., Puppala, S., Scott, W. R., Yengo, L., Tan, S-T., Taylor, H. A., Thameem, F., Wilson, G., Wong, T. Y., Njolstad, P. R., Levy, J. C., Mangino, M., Bonnycastle, L. L., Schwarzmayr, T., Fadista, J., Surdulescu, G. L., Herder, C., Groves, C. J., Wieland, T., Bork-Jensen, J., Brandslund, I., Christensen, C., Koistinen, H. A., Doney, A. S. F., Kinnunen, L., Esko, T., Farmer, A. J., Hakaste, L., Hodgkiss, D., Kravic, J., Lyssenko, V., Hollensted, M., Jorgensen, M. E., Jorgensen, T., Ladenvall, C., Justesen, J. M., Karajamaki, A., Kriebel, J., Rathmann, W., Lannfelt, L., Lauritzen, T., Narisu, N., Linneberg, A., Melander, O., Milani, L., Neville, M., Orho-Melander, M., Qi, L., Qi, Q., Roden, M., Rolandsson, O., Swift, A., Rosengren, A. H., Stirrups, K., Wood, A. R., Mihailov, E., Blancher, C., Carneiro, M. O., Maguire, J., Poplin, R., Shakir, K., Fennell, T., DePristo, M., de Angelis, M. H., Deloukas, P., Gjesing, A. P., Jun, G., Nilsson, P., Murphy, J., Onofrio, R., Thorand, B., Hansen, T., Meisinger, C., Hu, F. B., Isomaa, B., Karpe, F., Liang, L., Peters, A., Huth, C., O'Rahilly, S. P., Palmer, C. N. A., Pedersen, O., Rauramaa, R., Tuomilehto, J., Salomaa, V., Watanabe, R. M., Syvanen, A-C., Bergman, R. N., Bharadwaj, D., Bottinger, E. P., Cho, Y. S., Chandak, G. R., Chan, J. C. N., Chia, K. S., Daly, M. J., Ebrahim, S. B., Langenberg, C., Elliott, P., Jablonski, K. A., Lehman, D. M., Jia, W., Ma, R. C. W., Pollin, T. I., Sandhu, M., Tandon, N., Froguel, P., Barroso, I., Teo, Y. Y., Zeggini, E., Loos, R. J. F., Small, K. S., Ried, J. S., DeFronzo, R. A., Grallert, H., Glaser, B., Metspalu, A., Wareham, N. J., Walker, M., Banks, E., Gieger, C., Ingelsson, E., Im, H. K., Illig, T., Franks, P. W., Buck, G., Trakalo, J., Buck, D., Prokopenko, I., Magi, R., Lind, L., Farjoun, Y., Owen, K. R., Gloyn, A. L., Strauch, K., Tuomi, T., Kooner, J. S., Lee, J-Y., Park, T., Donnelly, P., Morris, A. D., Hattersley, A. T., Bowden, D. W., Collins, F. S., Atzmon, G., Chambers, J. C., Spector, T. D., Laakso, M., Strom, T. M., Bell, G. I., Blangero, J., Duggirala, R., Tai, E. S., McVean, G., Hanis, C. L., Wilson, J. G., Seielstad, M., Frayling, T. M., Meigs, J. B., Cox, N. J., Sladek, R., Lander, E. S., Gabriel, S., Burtt, N. P., Mohlke, K. L., Meitinger, T., Groop, L., Abecasis, G., Florez, J. C., Scott, L. J., Morris, A. P., Kang, H. M., Boehnke, M., Altshuler, D. & McCarthy, M. I. 4 Aug 2016 In : Nature. 536, 7614, p. 41-+ 29 p.

    Publication: Contribution to journalA1 Refereed journal article

  4. Biallelic Variants in UBA5 Link Dysfunctional UFM1 Ubiquitin-like Modifier Pathway to Severe Infantile-Onset Encephalopathy

    Muona, M., Ishimura, R., Laari, A., Ichimura, Y., Linnankivi, T., Keski-Filppula, R., Herva, R., Rantala, H., Paetau, A., Pöyhönen, M., Obata, M., Uemura, T., Karhu, T., Bizen, N., Takebayashi, H., McKee, S., Parker, M. J., Akawi, N., McRae, J., Hurles, M. E., Kuismin, O., Kurki, M. I., Anttonen, A-K., Tanaka, K., Palotie, A., Waguri, S., Lehesjoki, A-E., Komatsus, M. & DDD Study 1 Sep 2016 In : American Journal of Human Genetics. 99, 3, p. 683-694 12 p.

    Publication: Contribution to journalA1 Refereed journal article

  5. Heritability and Genome-Wide Association Analyses of Sleep Duration in Children: The EAGLE Consortium

    Marinelli, M., Pappa, I., Bustamante, M., Bonilla, C., Suarez, A., Tiesler, C. M., Vilor-Tejedor, N., Zafarmand, M. H., Alvarez-Pedrerol, M., Andersson, S., Bakermans-Kranenburg, M. J., Estivill, X., Evans, D. M., Flexeder, C., Forns, J., Gonzalez, J. R., Guxens, M., Huss, A., van IJzendoorn, M. H., Jaddoe, V. W. V., Julvez, J., Lahti, J., Lopez-Vicente, M., Lopez-Espinosa, M-J., Manz, J., Mileva-Seitz, V. R., Perola, M., Pesonen, A-K., Rivadeneira, F., Salo, P. P., Shahand, S., Schulz, H., Standl, M., Thiering, E., Timpson, N. J., Torrent, M., Uitterlinden, A. G., Smith, G. D., Estarlich, M., Heinrich, J., Räikkönen, K., Vrijkotte, T. G. M., Tiemeier, H. & Sunyer, J. 1 Oct 2016 In : Sleep.. 39, 10, p. 1859-1869 11 p.

    Publication: Contribution to journalA1 Refereed journal article

  6. Trans-ancestry meta-analyses identify rare and common variants associated with blood pressure and hypertension

    Surendran, P., Drenos, F., Young, R., Warren, H., Cook, J. P., Manning, A. K., Grarup, N., Sim, X., Barnes, D. R., Witkowska, K., Staley, J. R., Tragante, V., Tukiainen, T., Yaghootkar, H., Masca, N., Freitag, D. F., Ferreira, T., Giannakopoulou, O., Tinker, A., Harakalova, M., Mihailov, E., Liu, C., Kraja, A. T., Nielsen, S. F., Rasheed, A., Samue, M., Zhao, W., Bonnycastle, L. L., Jackson, A. U., Narisu, N., Swift, A. J., Southam, L., Marten, J., Huyghe, J. R., Stancakova, A., Fava, C., Ohlsson, T., Matchan, A., Stirrups, K. E., Bork-Jensen, J., Gjesing, A. P., Kontto, J., Perola, M., Shaw-Hawkins, S., Havulinna, A. S., Zhang, H., Donnelly, L. A., Groves, C. J., Rayner, N. W., Neville, M. J., Robertson, N. R., Yiorkas, A. M., Herzig, K-H., Kajantie, E., Zhang, W., Willems, S. M., Lannfelt, L., Malerba, G., Soranzo, N., Trabetti, E., Verweij, N., Evangelou, E., Moayyeri, A., Vergnaud, A-C., Nelson, C. P., Poveda, A., Varga, T. V., Caslake, M., de Craen, A. J. M., Trompet, S., Luan, J., Scott, R. A., Harris, S. E., Liewald, D. C. M., Marioni, R., Menni, C., Farmaki, A-E., Hallmans, G., Renstrom, F., Huffman, J. E., Hassinen, M., Burgess, S., Vasan, R. S., Felix, J. F., Uria-Nickelsen, M., Malarstign, A., Reilly, D. F., Hoek, M., Vogt, T. F., Lin, H., Lieb, W., Traylor, M., Markus, H. S., Highland, H. M., Justice, A. E., Marouli, E., Lindstrom, J., Uusitupa, M., Komulainen, P., Lakka, T. A., Rauramaa, R., Polasek, O., Rudan, I., Rolandsson, O., Franks, P. W., Dedoussis, G., Spector, T. D., Jousilahti, P., Mannisto, S., Deary, I. J., Starr, J. M., Langenberg, C., Wareham, N. J., Brown, M. J., Dominiczak, A. F., Connell, J. M., Jukema, J. W., Sattar, N., Ford, I., Packard, C. J., Esko, T., Magi, R., Metspalu, A., de Boer, R. A., van der Meer, P., van der Harst, P., Gambaro, G., Ingelsson, E., Lind, L., de Bakker, P. I. W., Numans, M. E., Brandslund, I., Christensen, C., Petersen, E. R. B., Korpi-Hyovalti, E., Oksa, H., Chambers, J. C., Kooner, J. S., Blakemore, A. I. F., Franks, S., Jarvelin, M-R., Husemoen, L. L., Linneberg, A., Skaaby, T., Thuesen, B., Karpe, F., Tuomilehto, J., Doney, A. S. F., Morris, A. D., Palmer, C. N. A., Holmen, O. L., Hveem, K., Willer, C. J., Tuomi, T., Groop, L., Karajamaki, A., Palotie, A., Ripatti, S., Salomaa, V., Alam, D. S., Majmnder, A. A. S., Di Angelantonio, E., Chowdhury, R., McCarthy, M. I., Poulter, N., Stanton, A. V., Sever, P., Amouyel, P., Arveiler, D., Blankenberg, S., Ferrieres, J., Kee, F., Kuulasmaa, K., Muller-Nurasyid, M., Veronesi, G., Virtamo, J., Deloukas, P., Elliott, P., Zeggini, E., Kathiresan, S., Melander, O., Kuusisto, J., Laakso, M., Padmanabhan, S., Porteous, D. J., Hayward, C., Scotland, G., Collins, F. S., Mohlke, K. L., Hansen, T., Pedersen, O., Boehnke, M., Stringham, H. M., Frossard, P., Newton-Cheh, C., Tobin, M. D., Nordestgaard, B. G., Caulfield, M. J., Mahajan, A., Morris, A. P., Tomaszewski, M., Samani, N. J., Saleheen, D., Asselbergs, F. W., Lindgren, C. M., Danesh, J., Wain, L. V., Butterworth, A. S., Howson, J. M. M., Munroe, P. B., CHARGE Heart Failure Consortiumm, EchoGen Consortiumm, Metastroke Consortiumm, Giant Consortiumm, EPIC-InterAct Consortium, Lifelines Cohort Study, Wellcome Trust Case Control Consor, Understanding Soc Sci Grp, EPIC-CVD Consortium, CHARGE Exome Chip Blood Pressure C, T2D-GENES Consortium, GoT2DGenes Consortium, ExomeBP Consortium & CHD Exome Consortium Oct 2016 In : Nature Genetics. 48, 10, p. 1151-1161 11 p.

    Publication: Contribution to journalA1 Refereed journal article

  7. The genetics of blood pressure regulation and its target organs from association studies in 342,415 individuals

    Ehret, G. B., Ferreira, T., Chasman, D. I., Jackson, A. U., Schmidt, E. M., Johnson, T., Thorleifsson, G., Luan, J., Donnelly, L. A., Kanoni, S., Petersen, A. -K., Pihurl, V., Strawbridge, R. J., Shungin, D., Hughes, M. F., Meirelles, O., Kaakinen, M., Bouatia-Naji, N., Kristiansson, K., Shah, S., Kleber, M. E., Guo, X., Lyytikainen, L-P., Fava, C., Eriksson, N., Nolte, I. M., Magnusson, P. K., Salfati, E. L., Rallidis, L. S., Theusch, E., Smith, A. J. P., Folkersen, L., Witkowska, K., Pers, T. H., Joehanes, R., Kim, S. K., Lataniotis, L., Jansen, R., Johnson, A. D., Warren, H., Kim, Y. J., Zhao, W., Wu, Y., Tayo, B. O., Bochud, M., Absher, D., Adair, L. S., Amin, N., Arkingl, D. E., Axelsson, T., Baldassarre, D., Balkau, B., Bandinelli, S., Barnes, M. R., Barroso, I., Bevan, S., Bis, J. C., Bjornsdottir, G., Boehnke, M., Boerwinkle, E., Bonnycastle, L. L., Boomsma, D. I., Bornstein, S. R., Brown, M. J., Burnier, M., Cabrera, C. P., Chambers, J. C., Chang, I-S., Cheng, C-Y., Chines, P. S., Chung, R-H., Collins, F. S., Connell, J. M., Doring, A., Dallongeville, J., Danesh, J., de Faire, U., Delgado, G., Dominiczak, A. F., Doney, A. S. F., Drenos, F., Edkins, S., Eicher, J. D., Elosua, R., Enroth, S., Erdmann, J., Eriksson, P., Esko, T., Evangelou, E., Evans, A., Fai, T., Farra, M., Felixl, J. F., Ferrieres, J., Ferrucci, L., Fornage, M., Forrester, T., Franceschinil, N., Franco, O. H., Franco-Cereceda, A., Fraser, R. M., Ganesh, S. K., Gao, H., Gertow, K., Gianfagna, F., Gigante, B., Giulianini, F., Goe, A., Goodall, A. H., Goodarzi, M., Gorski, M., Grassler, J., Groves, C. J., Gudnason, V., Gyllensten, U., Hallmans, G., Hartikainen, A-L., Hassinen, M., Havulinna, A. S., Hayward, C., Hercberg, S., Herzig, K-H., Hicks, A. A., Hingorani, A. D., Hirschhorn, J. N., Hofmanl, A., Holmen, J., Holmen, O. L., Hottenga, J-J., Howard, P., Hsiung, C. A., Hunt, S. C., Ikram, M. A., Illig, T., Iribarren, C., Jensen, R. A., Kahonen, M., Kang, H. M., Kathiresan, S., Keating, B. J., Khaw, K-T., Kim, Y. K., Kim, E., Kivimaki, M., Klopp, N., Kolovou, G., Komulainen, P., Kooner, J. S., Kosova, G., Krauss, R. M., Kuh, D., Kutalik, Z., Kuusisto, J., Kvaloy, K., Lakka, T. A., Lee, N. R., Lee, I-T., Lee, W-J., Levy, D., Li, X., Liang, K-W., Lin, H., Lin, L., Lindstrom, J., Lobbens, S., Mannisto, S., Muller, G., Muller-Nurasyid, M., Mach, F., Markus, H. S., Marouli, E., McCarthy, M. I., McKenzie, C. A., Meneton, P., Menni, C., Metspalu, A., Mijatovic, V., Moilanen, L., Montasser, M. E., Morris, A. D., Morrison, A. C., Mulas, A., Nagaraja, R., Narisu, N., Nikus, K., O'Donnell, C. J., O'Reilly, P. F., Ong, K. K., Paccaud, F., Palmer, C. D., Parsa, A., Pedersen, N. L., Penninx, B. W., Perola, M., Peters, A., Poulter, N., Pramstaller, P. P., Psaty, B. M., Quertermous, T., Rao, D. C., Rasheed, A., Rayner, N. W., Renstrom, F., Rettig, R., Rice, K. M., Roberts, R., Rose, L. M., Rossouw, J., Samani, N. J., Sanna, S., Saramies, J., Schunkert, H., Sebert, S., Sheu, W. H-H., Shin, Y-A., Sim, X., Smit, J. H., Smith, A. V., Sosa, M. X., Spector, T. D., Stancakova, A., Stanton, A. V., Stirrups, K. E., Stringham, H. M., Sundstrom, J., Swift, A. J., Syvanen, A-C., Tai, E-S., Tanaka, T., Tarasov, K. V., Teumer, A., Thorsteinsdottir, U., Tobin, M. D., Tremoli, E., Uitterlinden, A. G., Uusitupa, M., Vaez, A., Vaidya, D., van Duijn, C. M., van Iperen, E. P. A., Vasan, R. S., Verwoert, G. C., Virtamo, J., Vitart, V., Voight, B. F., Vollenweider, P., Wagner, A., Wain, L. V., Wareham, N. J., Watldns, H., Weder, A. B., Westra, H. J., Wilks, R., Wilsgaard, T., Wilson, J. F., Wong, T. Y., Yang, T-P., Yao, J., Yengo, L., Zhang, W., Zhao, J. H., Zhu, X., Bovet, P., Cooper, R. S., Mohlke, K. L., Saleheen, D., Lee, J-Y., Elliott, P., Gierman, H. J., Willer, C. J., Franke, L., Hovingh, G. K., Taylor, K. D., Dedoussis, G., Sever, P., Wong, A., Lind, L., Assimes, T. L., Njolstad, I., Schwarz, P. E. H., Langenberg, C., Snieder, H., Caulfield, M. J., Melander, E., Laakso, M., Saltevo, J., Rauramaa, R., Tuomilehto, J., Ingelsson, E., Lehtimaki, T., Hveem, K., Palmas, W., Marz, W., Kumar, M., Salomaa, V., Chen, Y-D. I., Rotter, J. I., Froguel, P., Jarvelin, M-R., Lakatta, E. G., Kuulasmaa, K., Franks, P. W., Hamsten, A., Wichmann, H-E., Palmer, C. N. A., Stefansson, K., Ridker, P. M., Loos, R. J. F., Chalcravarti, A., Deloukas, P., Morris, A. P., Newton-Cheh, C., Munroe, P. B., CHARGE-EchoGen Consortium, CHARGE-HF Consortium & Wellcome Trust Case Control Consor Oct 2016 In : Nature Genetics. 48, 10, p. 1171-1184 14 p.

    Publication: Contribution to journalA1 Refereed journal article

  8. Enrichment of rare variants in population isolates: single AICDA mutation responsible for hyper-IgM syndrome type 2 in Finland

    Trotta, L., Hautala, T., Hamalainen, S., Syrjanen, J., Viskari, H., Almusa, H., Lepisto, M., Kaustio, M., Porkka, K., Palotie, A., Seppanen, M. & Saarela, J. Oct 2016 In : European Journal of Human Genetics. 24, 10, p. 1473-1478 6 p.

    Publication: Contribution to journalA1 Refereed journal article

  9. A reference panel of 64,976 haplotypes for genotype imputation

    McCarthy, S., Das, S., Kretzschmar, W., Delaneau, O., Wood, A. R., Teumer, A., Kang, H. M., Fuchsberger, C., Danecek, P., Sharp, K., Luo, Y., Sidorel, C., Kwong, A., Timpson, N., Koskinen, S., Vrieze, S., Scott, L. J., Zhang, H., Mahajan, A., Veldink, J., Peters, U., Pato, C., van Duijn, C. M., Gillies, C. E., Gandin, I., Mezzavilla, M., Gilly, A., Cocca, M., Traglia, M., Angius, A., Barrett, J. C., Boomsma, D., Branham, K., Breen, G., Brummett, C. M., Busonero, F., Campbell, H., Chan, A., Che, S., Chew, E., Collins, F. S., Corbin, L. J., Smith, G. D., Dedoussis, G., Dorr, M., Farmaki, A-E., Ferrucci, L., Forer, L., Fraser, R. M., Gabriel, S., Levy, S., Groop, L., Harrison, T., Hattersley, A., Holmen, O. L., Hveem, K., Kretzler, M., Lee, J. C., McGue, M., Meitinger, T., Melzer, D., Min, J. L., Mohlke, K. L., Vincent, J. B., Nauck, M., Nickerson, D., Palotie, A., Pato, M., Pirastu, N., McInnis, M., Richards, J. B., Sala, C., Salomaa, V., Schlessinger, D., Schoenherr, S., Slagboom, P. E., Small, K., Spector, T., Stambolian, D., Tuke, M., Tuomilehto, J., van den Berg, L. H., Van Rheenen, W., Volker, U., Wijmenga, C., Toniolo, D., Zeggini, E., Gasparini, P., Sampson, M. G., Wilson, J. F., Frayling, T., de Bakker, P. I. W., Swertz, M. A., McCarroll, S., Kooperberg, C., Dekker, A., Altshuler, D., Willer, C., Iacono, W., Ripatti, S., Soranzo, N., Walter, K., Swaroop, A., Cucca, F., Anderson, C. A., Myers, R. M., Boehnke, M., McCarthy, M. I., Durbin, R., Abecasis, G., Marchini, J. & Haplotype Reference Consortium Oct 2016 In : Nature Genetics. 48, 10, p. 1279-1283 5 p.

    Publication: Contribution to journalA1 Refereed journal article

  10. An integrated genetic-epigenetic analysis of schizophrenia: evidence for co-localization of genetic associations and differential DNA methylation

    Hannon, E., Dempster, E., Viana, J., Burrage, J., Smith, A. R., Macdonald, R., St Clair, D., Mustard, C., Breen, G., Therman, S., Kaprio, J., Toulopoulou, T., Pol, H. E. H., Bohlken, M. M., Kahn, R. S., Nenadic, I., Hultman, C. M., Murray, R. M., Collier, D. A., Bass, N., Gurling, H., McQuillin, A., Schalkwyk, L. & Mill, J. 30 Aug 2016 In : Genome Biology. 17, 16 p., 176

    Publication: Contribution to journalA1 Refereed journal article

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