Panu Juhani Somervuo

!!Person

Curriculum vitae

Viimeisimmät julkaisut

  1. RNA-seq Data Analysis: A Practical Approach

    Korpelainen, E., Tuimala, J., Somervuo, P. J., Huss, M. & Wong, G. 19.09.2014 CRC Press, Taylor & Francis Group. 322 Sivumäärä

    Julkaisu: Kirja/kokoomateosC1 Kustannettu tieteellinen erillisteos

  2. The Glanville fritillary genome retains an ancient karyotype and reveals selective chromosomal fusions in Lepidoptera

    Ahola, V., Lehtonen, R., Somervuo, P., Salmela, L., Koskinen, P., Rastas, P., Valimaki, N., Paulin, L., Kvist, J., Wahlberg, N., Tanskanen, J., Hornett, E. A., Ferguson, L. C., Luo, S., Cao, Z., de Jong, M. A., Duplouy, A., Smolander, O-P., Vogel, H., McCoy, R. C., Qian, K., Wong, S. C., Zhang, Q., Ahmad, F., Haukka, J. K., Joshi, A., Salojarvi, J., Wheat, C. W., Grosse-Wilde, E., Hughes, D., Katainen, R., Pitkanen, E., Ylinen, J., Waterhouse, R. M., Turunen, M., Vaharautio, A., Ojanen, S. P., Schulman, A. H., Taipale, M., Lawson, D., Ukkonen, E., Makinen, V., Goldsmith, M. R., Holm, L., Auvinen, P., Frilander, M. J. & Hanski, I. 09.2014 julkaisussa : Nature Communications. 5, 9 Sivumäärä4737

    Julkaisu: ArtikkelijulkaisuA1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

  3. Transcriptome Analysis Reveals Signature of Adaptation to Landscape Fragmentation

    Somervuo, P., Kvist, J., Ikonen, S., Auvinen, P., Paulin, L., Koskinen, P., Holm, L., Taipale, M., Duplouy, A., Ruokolainen, A., Saarnio, S., Siren, J., Kohonen, J., Corander, J., Frilander, M. J., Ahola, V. & Hanski, I. 02.07.2014 julkaisussa : PLoS One. 9, 7, 12 Sivumäärä101467

    Julkaisu: ArtikkelijulkaisuA1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Näytä kaikki (40) »

Viimeisimmät aktiviteetit

  1. Epigenetics, coding and non-coding RNAs - Challenging NGS data

    Panu Juhani Somervuo (Puhuja: esitelmän pitäjä), 27.06.2014

    Aktiviteetti: Konferenssit, kurssit ja seminaarit Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  2. COST training school: Next Generation Sequencing Data Analysis

    Panu Juhani Somervuo (Puhuja: esitelmän pitäjä), 29.05.2012

    Aktiviteetti: Konferenssit, kurssit ja seminaarit Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

  3. NGS Assembly Course

    Panu Juhani Somervuo (Puhuja: esitelmän pitäjä), 05.09.2012

    Aktiviteetti: Konferenssit, kurssit ja seminaarit Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Näytä kaikki (6) »

Viimeisimmät projektit

  1. Phytopathogen Research (PHYTOPATH)

    Asiegbu, F., Kasanen, R., Pasonen, H., Lehr, N., Chen, H., Jaber, E., Keriö, S., Lu, J., Niskanen , A., Nylund, S., Mgbeahuruike, A., Raffaello, T., Rytkönen, A., Sun, H., Terhonen, E., Pirhonen, M., Laurila, J., Nissinen, R., Nykyri, J., Pasanen, M., Hannukkala, A., Valkonen, J., Akita, M., Goytia, E., Rajamäki, M., Samouilova, O., Siddiqui, S., Somervuo, P. J., Takikawa, Y., Wang, Q., Wilson, P., Aittamaa, M., Ala-Poikela, M., Cuellar, W., Haikonen, T., Hiltunen, L. H., Kelloniemi, J., Kirchner, S., Lehtonen, M. J., Lehtonen, M., Marttinen, E., Mbanzibwa, D., Santala, J., Tian, Y., Tugume, A., Weinheimer, I. & Vuorinen, A.

    23.02.11 → …

    Projekti: Tutkimuksen arviointi 2011

Näytä kaikki (3) »

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

My background is in signal processing, pattern recognition, and machine learning. Before starting to do bioinformatics, I was working with automatic speech recognition (ASR) and neural networks at Neural Networks Research Centre, Helsinki University of Technology. Year 2005 I moved to Viikki campus of University of Helsinki (UH). During 2005-2010 I did microarray data analysis including detection, gene expression, and array comparative genomic hybridization (aCGH). Majority of that work was done with custom arrays where I did also the probe design. During that time I participated as a teacher in several microarray courses at UH and IT center CSC, and one Erasmus course in Italy. Year 2010 I joined Metapopulation Research Group (MRG) to participate in a butterfly sequencing project. Its first step, now in progress, is to make a draft assembly of Melitaea cinxia genome.

My general research goal is to understand biology better. Being an engineer, I am interested in machine learning methods and Bayesian modeling. My dream would be to utilize those tools in collaboration with biologists to unravel a meaningful biological process and give it a mechanistic explanation.

ID: 78962